PCR反應(yīng)的最大特點(diǎn)是擴(kuò)增能力強(qiáng),靈敏度高,但頭痛問題易受污染,少量污染可造成假陽(yáng)性。面對(duì)樣品交叉污染、試劑儀器交叉污染、克隆質(zhì)粒污染、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染和氣溶膠污染等多種污染源,氣溶膠是由固體或液體顆粒分散懸浮在氣體介質(zhì)中形成的膠體分散體系。當(dāng)空氣和液體表面摩擦,如在操作中,反應(yīng)管是劇烈搖動(dòng)。當(dāng)蓋打開時(shí),當(dāng)樣品被吸走時(shí),可以形成氣溶膠,形成污染注入槍的重復(fù)樣品吸收。這種污染是悄悄地來的,是無(wú)法防止的。
雖然這些污染對(duì)PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響越來越受到重視,但大多數(shù)PCR實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)采取了多種污染控制方法,如定期清洗、劃分操作區(qū)域、裝載試劑、謹(jǐn)慎操作、重復(fù)實(shí)驗(yàn)、多角度驗(yàn)證結(jié)果等。然而,微量核酸片段可以被放大,所以對(duì)污染物的控制不僅可以消除和避免,關(guān)鍵是要從源頭上進(jìn)行控制。目前,大多數(shù)生物實(shí)驗(yàn)室、分子實(shí)驗(yàn)每天都在大規(guī)模進(jìn)行,污染源已經(jīng)無(wú)處不在、專屬性、非特異性、同源性、非同源性、廣泛分布于樣品容器、實(shí)驗(yàn)室表格、試劑溶液、儀器表面管附件等。以下是為消除這些污染源而制定的方法:
解決PCR實(shí)驗(yàn)室污染問題的方法
1.酒精擦拭:沉淀核酸,以確保污染的表面污染能在一定程度上得到緩解(簡(jiǎn)單、方便、低成本)。
2.修飾:標(biāo)記遺傳物質(zhì),防止聚合酶與核酸結(jié)合,從而抑制DNA的擴(kuò)散(效果較好)。
3.酶解:酶能將長(zhǎng)鏈核酸分子降解成小片段(速度快,效果較好)。
4.高壓變性:高壓可將核酸降解成20-30 bp(徹底、低成本)的小片段。
5.紫外線照射:PCR產(chǎn)物中嘧啶堿形成二聚體并終止(方便、范圍廣、成本低)。
在有實(shí)驗(yàn)室的地方,實(shí)驗(yàn)室的污染是不可避免的。實(shí)驗(yàn)室的污染不僅會(huì)影響實(shí)驗(yàn)和科學(xué)研究的質(zhì)量和效果,而且會(huì)損害實(shí)驗(yàn)室工作人員的健康。一個(gè)好的PCR實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該始終重視污染監(jiān)測(cè),并考慮污染是否是污染造成的,以便采取措施防止和消除污染。